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HiFi One-Step RT-PCR Mix(電泳)

簡要描述:

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更新時間:2024-01-12

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HiFi One-Step RT-PCR Mix(電泳)

商品屬性:

產品名稱

規(guī)格

貨號

HiFi One-Step RT-PCR Mix(電泳)

250T

A-PJ1036

6.png


末端轉移酶(TdT)是一種不依賴于模板的 DNA 聚 合酶,催化脫氧核苷酸結合到 DNA 分子的 3’羥基端。帶有 突出、凹陷或平滑末端的單雙鏈 DNA 分子均可作為 TdT 的 底物,加尾長度可達 5~300nt。本酶經電子重構架技術篩選, 使其可以在 45°C 高溫下反應,從而避免因 DNA 二級結構造 成的加尾效率下降。 該酶廣泛用于 DNA 的 3’末端添加同聚物、利用修飾堿 基(如 ddNTP,DIGdUTP)標記 DNA 3’末端、TdT 介導的 dUTP 缺口末端標記技術(細胞凋亡的原位檢測)等試驗。

活性定義:37 ℃ 60 分鐘內,催化 1nmol dNTP 加入到多聚核苷酸 3’羥基末端中所需的酶量定義為 1 個活性單位
熱失活:75°C 20min。
儲存:-20℃ 可保存 3 年。
注意事項
1、適量 EDTA 可使 Terminal Transferase 的活性喪失。
2、金屬離子螯合劑,較高濃度的銨根離子、氯離子、碘例子和磷酸根離子均對 Terminal Transferase 活性具有抑制作用。
3、DNA 末端 mol 數的計算,長度為 100bp 的 DNA:1pmol末端 DNA=0.33ng。

本試劑采用穩(wěn)定高效的 RT-PCR 預混體系,是以 RNA 為模板進行一步法 RT-PCR 的專用試劑。其原理為用基因特 異性引物進行反轉錄反應,獲得第一鏈 cDNA(不可使用 Oligo(dT)或 Random Rimer 合成第一鏈 cDNA),再使 用基因特異性正向引物和反向引物進行 PCR 擴增,在同一 反應體系中一步完成從反轉錄到 PCR 的全部過程。反應體 系中已含有電泳所需的指試劑(藍色和黃色),反應后可以 直接進行電泳。 在本試劑盒中,將耐熱 M-MLV 反轉錄酶、Rnase Inhibitor、 Hotstart 高 保 真 DNA 聚合酶以及穩(wěn)定劑等配制成 50×One-Step Enzyme Mix 預混液;反應 Buffer、dNTP 以及 電泳指示染料配制成 5×HiFi One-Step RT-PCR Buffer,因此 使得操作更加簡單便,擴增產物可用于平端克隆和 DNA 測 序。
主要優(yōu)勢:
? 耐熱M-MLV反轉錄酶可在55℃反應能更好的打開復雜二級結構,只需 10min 即可完成逆轉錄。
? DNA 聚合酶為熱啟動型高保真酶,能夠有效的抑制非特異性反應且具有較高的校正活性,酶激活僅需 2min。
? 具有寬泛的模板量兼容性,10 ng~1μg 都可有效擴增。
? 反應過程中無需開蓋,避免了操作過程中的污染危害。
組分
名稱 250T
50×One-Step Enzyme Mix 100 μl
5×HiFi One-Step RT-PCR Buffer 1 ml
RNase Free H2O 1 ml×3
儲存:請置于-20°C,可保存 2 年;避免反復凍融。
注意:
1.50×One-Step Enzyme Mix 粘度高,第一次使用之前要離心收集至反應管底部,吸取時應緩慢小心。
2.由于使用了 Hotstart 高保真 DNA 聚合酶,反應配制可在常溫進行,但各組分應-20°C 保存。
實驗操作和反應條件:
1. 按以下組分配制反應液
RNA(病毒 DNA/RNA 樣品直接使用 2~10μl) 10 ng~1 μg
5×HiFi One-Step RT-PCR Buffer 4 μl
50×HiFi One-Step RT-PCR Enzyme Mix 0.4 μl
基因特異性上游引物(10μM) 0.8 μl
基因特異性下游引物(10μM) 0.8 μl
Rnase Free H2O Up to 20 μl
注意:超過 1 μg 的 RNA 模板量會抑制 PCR 反應,建議第一次可使用 200 ng 的 RNA 模板,然后根據結果進行優(yōu)化。
2. 在 PCR 儀上按以下條件進行 RT-PCR 反應:
55°C, 10min 逆轉錄反應
95°C, 2min 失活 M-MLV,并激活高保真聚合酶
95°C, 20s 30~40 cycles
TM°C, 20s
72°C ,
2Kb/min
72°C, 2min 末端延伸
3. PCR 反應結束后,可取 5 μl 產物直接進行電泳檢測。預混液中已經包含綠色染料,無需再加入 DNA Loading Buffer。1% Agarose 電泳時,藍色指示劑指示 3~5 kb,黃色指示劑指示<50 bp。

5.png

PCR 反應需要使用哪些試劑和設備?

試劑:
模板DNA:PCR反應需要模板DNA,如從細胞、組織、血液中提取DNA等;引物:PCR反應的兩個引物,分別與模板DNA的兩端配對擴增所需的特定區(qū)域,引物也可以合成為TA克隆等過程中使用到的引物;dNTPs:PCR反應中需要四種dNTPs,包括脫氧腺苷酸(dATP)、脫氧胸苷酸(dCTP)、脫氧鳥苷酸(dGTP)、脫氧胞嘧啶酸(dTTP),用于細胞分裂、DNA合成等生物學過程,用于PCR擴增的模板DNA鏈的延伸和擴增;Taq DNA聚合酶:PCR反應需要的聚合酶,一般使用Taq聚合酶,還有一些其他種類的聚合酶如PFU、Phusion等,用于擴增DNA鏈;PCR buffer溶液:對PCR反應具有緩沖作用,調節(jié)反應pH,硫代硫酸氫鹽SDS、小分子有機化合物如甲醛,可增強PCR反應特異性,從而提高反應效率;酶切體系:PCR擴增往往涉及到重組、構建和測序等等實驗步驟,常常需要進行酶切操作。MARK:一種分子量標準,用來判別DNA片段大小的工具。DNA純化試劑盒:用于純化PCR反應產物;
設備:
PCR儀:用于控制反應溫度,保證PCR反應時不同溫度環(huán)節(jié)的嚴格控制;電泳槽:用于分離PCR擴增產物;核酸提取儀:從組織樣本中全自動提取核酸。  這些試劑和設備在PCR分子生物學技術中均是,只有在有序齊全的基礎上,才能進行PCR反應并得出準確結果。

PCR相關基礎實驗:

PCR反應基本步驟一般的聚合酶鏈式反應由20到35個循環(huán)組成,每個循環(huán)包括以下3個步驟:

一、變性:

利用高溫(93-98℃)使雙鏈DNA分離。高溫將連接兩條DNA鏈的氫鍵打斷。在第一個循環(huán)之前,通常加熱長一些時間以確保模板和引物分離,僅以單鏈形式存在。該步驟時間1-2分鐘,接下來PCR儀就控制溫度進入循環(huán)階段。

二、退火或稱接合,復性:

在DNA雙鏈分離后,降低溫度使得引物可以結合于單鏈DNA上。此階段的溫度通常低于引物熔點5℃。錯誤的退火溫度可能導致引物不與模板結合或者錯誤地結合。該步驟時間1-2分鐘。

三、延伸:

DNA聚合酶由降溫時結合上的引物開始沿著DNA鏈合成互補鏈。此階段的溫度依賴于DNA聚合酶。該步驟時間依賴于聚合酶以及需要合成的DNA片段長度。傳統(tǒng)的Taq估計合成1000bp/min、較新的Tbr(來自于嗜熱菌Thermus brockianus)約40秒、商業(yè)公司生產的融合型聚合酶僅需約10-15秒。

PCR反應條件優(yōu)化:

1、變性溫度和時間:

保證模板DNA解鏈是保證整個PCR擴增成功的關鍵。加熱90~95°C, 30~60s,再復雜的DNA 分子也可變性為單鏈。溫度過高或高溫持續(xù)時間過長,可對Taq酶活性和dNTP分子造成損害。

2、復性溫度和時間:

PCR擴增特異性取決于復性過程中引物與模板的結合。復性溫度越高,產物特異性越高。復性溫度越低,產物特異性越低。需根據引物的Tm值具體設定。

3、延伸溫度和時間:

一般位于Taq酶最適作用溫度70~75°C之間。引物小于16個核苷酸時,過高的延伸溫度不利于引物與模板的結合,可以緩慢升溫到70~75°C。延伸反應時間,可根據待擴增片段的長度而定,小于1kb, 1min足夠;大于1kb需加長延伸時間。Taq酶可根據1kb/min增加時間。這里需要注意,延伸時間過長可能出現(xiàn)非特異擴增。因此需要設置恰到好處的延伸時間。

4、循環(huán)數:

其他參數選定后,PCR循環(huán)次數主要取決于模板DNA的濃度。理論上說20?25次循環(huán)后,PCR產物的積累即可達到最大值,實際操作中由于每步反應的產率不可能達到100%,因此不管模板濃度是多少,20~30次是比較合理的循環(huán)次數。循環(huán)次數越多,非特異擴增增加。

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