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Bst 4.0 Basic Mix(with UDG)

簡(jiǎn)要描述:

Bst 4.0 Basic Mix(with UDG)公司正在出售的產(chǎn)品:耐DDP鼻咽癌胞,1μg/ml 嗜鉻粒B封閉多肽 同牛皰疹病毒型牛皰疹乳頭炎病毒PCR檢測(cè)試劑盒 大鼠尿激型纖溶原激活物(uPA)ELISA檢測(cè)試劑盒 還原型谷肽(GSH)活性比色法檢測(cè)試劑盒 爛泥假單胞菌 MYC結(jié)合蛋白2抗體

更新時(shí)間:2024-01-12

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Bst 4.0 Basic Mix(with UDG)

商品屬性:

產(chǎn)品名稱

規(guī)格

貨號(hào)

Bst 4.0 Basic Mix(with UDG)

100T

A-PJ1013

Bst 4.0 Basic Mix(with UDG)

2000Tx25μl

A-PJ1013

QQ截圖20240110094643.jpg


該制品為雙組分的試劑,Basic Buffer Mix 包含了反應(yīng)緩沖液、Mg2+、dU/A/C/GTP(不含 dTTP)、凍干賦形劑,酶 Mix 包含 Bst 4.0 DNA/RNA 聚合酶、熱敏 UDG。得益于 Bst 4.0 識(shí)別 dUTP 底物,反應(yīng)底物中不包含dTTP,因此擴(kuò)增產(chǎn)物均為 dUTP 產(chǎn)物,在配合熱敏 UDG的情況下,實(shí)現(xiàn)防污染性能。在實(shí)際測(cè)試中,含有 10e5Copies 的污染物的條件下,抑制污染擴(kuò)增。本制品尤其適用于開(kāi)蓋的 LAMP 反應(yīng)(如試紙條檢測(cè))、密封腔體(污染風(fēng)險(xiǎn)較高)的檢測(cè)試驗(yàn)(如定量 PCR腔體)。
試劑使用特點(diǎn):
(1)Basic Buffer Mix 中不含染料,可自行添加 SYBR Green、Eva Green 等染料進(jìn)行熒光檢測(cè)。
(2)本試劑適用于開(kāi)蓋檢測(cè)如核酸試紙條檢測(cè)。
(3)試劑中含有凍干賦形劑,試劑可直接凍干,無(wú)需再優(yōu)化凍干配方。
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儲(chǔ)存:-20℃保存 1 年;-80℃保存 2 年;短期使用放置于2-8℃,保存 1 個(gè)月。反復(fù)凍融 10 次,不影響使用。如有白色沉淀,于 37℃水浴放置 10min 后溶解沉淀,不影響使用。
使用方法:
1. 配制 LAMP 反應(yīng)體系
2.5xBst4.0 Basic BufferMix 10 μl
25xBst4.0/UDG Enzyme 1 μl
10xLAMP Primer Mix 2.5 μl
模板 DNA/RNA X μl
ddH2O 到總體積 25 μl
10xLAMP Primer Mix 濃度:FIP/BIP 分別為 16 μM、LoopF/B 分別為 4~8 μM、F3/B3 分別為 2 μM。
注意:如何應(yīng)用核酸試紙條進(jìn)行特異性檢測(cè),可來(lái)信咨詢。
2. 反應(yīng)體系配好后,室溫(25-37°C)放置 2min,以消化去除潛在的核酸污染,隨后置于 65°C 進(jìn)行反應(yīng)15~30min。
試劑凍干策略(有凍干經(jīng)驗(yàn)人員操作):
1. 配制 LAMP 凍干體系
2.5xBst4.0 Basic BufferMix 10 μl
25xBst4.0/UDG Enzyme 1 μl
10xLAMP Primer Mix 2.5 μl
ddH2O 到體積 1.5 μl
凍干總體積 15 μl
2. 體系配制完畢后,加入 0.2 ml EP 管進(jìn)行上機(jī)凍干。該試劑的凍干體積為 15 μl, 檢測(cè)反應(yīng)體積為 25 μl。

特別說(shuō)明:
(1)本試劑防污染原理為:熱敏 UDG 消化去除含有 dUTP的擴(kuò)增產(chǎn)物,熱敏 UDG 在隨后 50℃以上迅速失活,并不影響后續(xù) LAMP 擴(kuò)增。因此,本試劑無(wú)法去除采用 dTTP擴(kuò)增的污染物,也不能消化天然的核酸底物(DNA/RNA)。為避免擴(kuò)增氣溶膠污染,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)長(zhǎng)期使用本試劑進(jìn)行實(shí)驗(yàn),一旦使用 dTTP 試劑擴(kuò)增后,造成實(shí)驗(yàn)室污染,采用本試劑不會(huì)消除假陽(yáng)性擴(kuò)增。
(2)本試劑適用基于 OG 染料變色法、SYBR Green 法、基于 Biotin/FAM 探針的核酸膠體金法( 具有膠體金法特異性使用策略,如需技術(shù)支持,請(qǐng)來(lái)信咨詢)。本試劑不支持 HNB、pH 顯色法。其它使用策略自行優(yōu)化調(diào)整。
(3)基于本試劑, 提供凍干制備服務(wù)。八聯(lián)管起訂量 480T,凍干球起訂量 2000T。

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PCR基本步驟及注意事項(xiàng)?

一、實(shí)驗(yàn)原理

PCR是體外人工選擇性擴(kuò)增DNA的一種方法,它類似于生物體內(nèi)DNA的復(fù)制。在生物體內(nèi)DNA復(fù)制需要模板、引物、DNA聚合酶、DNA解旋酶、 dNTPs;而體外PCR反應(yīng)同樣需要類似的成分,有模板、引物、PCR Buffer、Taq酶、dNTPs。其中引物是人工設(shè)計(jì)的特定序列,實(shí)現(xiàn)對(duì)特定位置的擴(kuò)增;PCR Buffer提供一個(gè)反應(yīng)的緩沖環(huán)境;反應(yīng)過(guò)程同生物體內(nèi)一樣,DNA雙鏈打開(kāi),引物結(jié)合模板,延伸形成新鏈。而這些過(guò)程在生物體內(nèi)靠DNA解旋酶解鏈,而在體外在通過(guò)控制反應(yīng)溫度實(shí)現(xiàn)的。如常用94℃變性模板DNA打開(kāi)雙鏈,在退火溫度處引物結(jié)合到模板上,最后在72℃完成延伸,并反復(fù)重復(fù)此過(guò)程即可實(shí)現(xiàn)對(duì)特定片段DNA的大量擴(kuò)增。到第三循環(huán)開(kāi)始才產(chǎn)生出和靶DNA區(qū)段相同的DNA分子,進(jìn)一步循環(huán)地產(chǎn)生出靶DNA區(qū)段的指數(shù)加倍。

在擴(kuò)增后期,由于產(chǎn)物積累,使原來(lái)呈指數(shù)擴(kuò)增的反應(yīng)變成平坦的曲線,產(chǎn)物不再隨循環(huán)數(shù)而明顯上升,這稱為平臺(tái)效應(yīng)。平臺(tái)期(Plateau)會(huì)使原先由于錯(cuò)配而產(chǎn)生的低濃度非特異性產(chǎn)物繼續(xù)大量擴(kuò)增,達(dá)到較高水平。因此,應(yīng)適當(dāng)調(diào)節(jié)循環(huán)次數(shù),在平臺(tái)期前結(jié)束反應(yīng), 減少非特異性產(chǎn)物。到達(dá)平臺(tái)期(Plateau)所需循環(huán)次數(shù)取決于樣品中模板的拷貝。

二、主要的成分

1.模板可以是多種形式,主要包括基因組DNA、質(zhì)粒DNA、攜帶病毒的基因組DNA、PCR產(chǎn)物,cDNA等,但不能為RNA。對(duì)于不同類型的模板,其主要不同在于預(yù)變性的時(shí)間以及模板的量。一般對(duì)于大的基因組DNA預(yù)變性時(shí)間10min足夠,質(zhì)粒DNA2min、攜帶病毒的基因組DNA預(yù)變性2min、PCR產(chǎn)物預(yù)變性2min即可。

注意cDNA為單鏈DNA,但仍可做PCR的模板,只不過(guò)在第一輪循環(huán)時(shí)只有一個(gè)引物結(jié)合,合成另一條鏈。從第二輪開(kāi)始,兩個(gè)引物均與特異位點(diǎn)結(jié)合,從而實(shí)現(xiàn)了與常規(guī)PCR的接軌。而同作為單鏈的RNA卻不能進(jìn)行PCR擴(kuò)增,原因就在于實(shí)現(xiàn)PCR反應(yīng)的是DNA聚合酶,只能特意識(shí)別DNA鏈。

2.對(duì)于模版的量來(lái)說(shuō),一般25ul體系DNA的質(zhì)量為50—100ng。對(duì)于基因組DNA由于其結(jié)構(gòu)比較復(fù)雜,提取的濃度也往往比較大,為防止?jié)舛冗^(guò)大對(duì)PCR造成影響,故需對(duì)提取的DNA進(jìn)行梯度稀釋。否則濃度過(guò)高則可能會(huì)引起非特異性擴(kuò)增。對(duì)于質(zhì)粒及PCR產(chǎn)物由于其結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,且提取濃度一般較低,則無(wú)需稀釋。

PCR實(shí)驗(yàn)中應(yīng)該注意的問(wèn)題有哪些?

沒(méi)有ct值

檢測(cè)結(jié)果遇到?jīng)]有Ct值情況,排查是否有以下問(wèn)題:

1、循環(huán)數(shù)不夠(一般不超過(guò)45循環(huán),不僅背景值提高,定量也不準(zhǔn));

2、PCR程序設(shè)置錯(cuò)誤,檢測(cè)熒光信號(hào)的步驟有誤。一般SG法采用72℃延伸時(shí)采集,TaqMan法則一般在退火結(jié)束時(shí)或延伸時(shí)采集信號(hào),另外熒光采集是否選中;

3、引物或探針降解??赏ㄟ^(guò)PAGE電泳檢測(cè)引物和探針是否降解;

4、模板量可能降解或上樣量不足(不超過(guò)500ng,根據(jù)試劑盒說(shuō)明書即可), 對(duì)未知濃度的樣本應(yīng)從系列稀釋樣本的最高濃度做起;如果發(fā)生模板降解,應(yīng)考慮樣本準(zhǔn)備中雜質(zhì)的引入及反復(fù)凍融的情況,建議將模板樣本小量分裝儲(chǔ)備,避免反復(fù)凍融;

5、引物探針是否合適(尤其是引物跨越內(nèi)含子,以確保擴(kuò)增基因組DNA;上下游引物Tm值超過(guò)4℃以上也會(huì)影響擴(kuò)增)。

ct值過(guò)晚

在相對(duì)定量中, Ct值一般控制在15—25之間比較好,如果在絕對(duì)定量中, 對(duì)低拷貝數(shù)的樣品,Ct值會(huì)增大, 但是一般不宜超過(guò)40循環(huán), 否則定量不準(zhǔn)確。

因此,判斷Ct值出現(xiàn)過(guò)晚是否屬于非正常情況, 需要根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和目的進(jìn)行。

1、擴(kuò)增效率低。引物之間或者引物和探針的比例不合適, 需要進(jìn)行優(yōu)化;引物或探針設(shè)計(jì)不合理, 需要重新設(shè)計(jì);

2、PCR程序不合適, 改用三步法進(jìn)行反應(yīng), 或者優(yōu)化退火/延伸溫度, 可以適當(dāng)降低退火溫度; 退火/延伸時(shí)間短(可以在推薦的時(shí)間條件下延長(zhǎng)10s);

3、MgCl2濃度不合適,增加鎂離子濃度等。PCR各種反應(yīng)成分的降解或加樣量的不足;

4、PCR產(chǎn)物太長(zhǎng)。PCR產(chǎn)物設(shè)計(jì)超過(guò)500bp;

5、模板中存在抑制物。用高純度模板進(jìn)行PCR檢測(cè)或?qū)⒛0暹M(jìn)行稀釋。

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